医院管理办公室是对外代表学校履行办医主体责任的主要职能部门。负责对附属医院（包括直属、参照直属管理及非直属附属医院）以医疗为主的相关工作进行常规管理，对医院总体发展、医疗能力水平、医疗质量安全的提升履行规划、组织、指导、协调、服务和监督职责。

1.围绕学校总体发展规划目标，代表学校组织开展调查研究，负责提出附属医院（包括直属、参照直属管理及非直属附属医院）发展战略规划，明确目标定位，持续优化布局，推进高质量发展。

2.统筹协调附属医院发展重点工作，高质量推进国家中医临床研究基地、国家区域中医诊疗中心、国家级重点专科等建设工作，推动创建国家医学中心等重点建设项目。

3.协调服务附属医院与学校职能部门的对接，推进医教协同，科学整合附属医院医、教、研资源，促进附属医院、学校临床和相关院部的优势资源整合，开展协同创新，实现共同发展。

4.负责做好附属医院专项考核和年度绩效考核工作及非直属附属医院的准入评审和认定工作。

5.做好上级行业管理部门与附属医院间的协调、推进、联络工作，协助附属医院加强党风廉政建设和医疗行风建设工作。